環境
ESXi 6.5d (2017/06/16時点で出ているパッチ適用済み）
Core i5 4570 / 24GB RAM / SATA SSD
Gigabyte Z87X-UD3H
2017/07/22 追記
Ryzen を使用している場合、この手順を行ってはいけません。
SATAが認識できなくなります（恐らく） また、ESXi起動後にシステム領域を見失う為
復帰には再インストールしかなくなります。（設定を変更はできるが、保存できない）
症状
時々VMがひっかかる。（動作が止まる）
完全に停止してしまうので、色々と処理オチしたりする。
確定方法
ホスト→監視→イベント でdatastoreへのアクセスが切断された旨のログが出力されている。
切断自体は一瞬で回復している。
原因
6.5以降？のSATAドライバがいまいち安定していない
対応
以下のコマンドで新しいSATAドライバを無効化して、古いSATAドライバに入れ替える
ホストのリブートが必要
esxcli system module set --enabled=false --module=vmw_ahci